Chevalier des Palmes académiques, professeur à l'université de Rennes 2, où il a dirigé le département de Musique et le département des Arts du spectacle, Gilles Mouëllic a enseigné le jazz et le cinéma.
Il a écrit de nombreux articles pour Africultures.
Il a notamment consacré plusieurs articles au dramaturge et écrivain Koffi Kwahulé, et publié un recueil d'entretiens intitulé Frères de sons : Koffi Kwahulé et le jazz (Théâtrales, 2007).
Il est décédé le 14 juin 2023 à l'âge de 61 ans.